制度化阶段（１９９０年以后）
制度化阶段始于民政部接到『中共中央「全国村级组织建设工作座谈会纪要」转达的通告』，而于全国展开村民自治示范点（最初选定５９个村落）开始。以此为肇端，中央命各省制定『村民委员会组织法实施办法』做为地方法规，并将其扩大至１６省，总计在二十二个省、市、自治区内，展开村民委员会组织的制度化。
在实际选举方面，由于上述第一次选举的时点并不一致，故第二次改选选举时亦是由各省、市、自治区个别实施，因而屡见同一省份的选举时期亦不统一的事态。然而，在此过程中值得一提的是，地方各层级第二次村长改选选举的准备已确实落实。例如，各省政府以自身或省民政厅、省人民政府办公厅的名义，向地区行署、县、市等发布有关实施村民委员会选举的通告，甚至县、市政府、办公室亦向基层下达更具体的选举实施方案。此点除将其具体化之外，同时亦浮现统一化的动向。代表性的事例为山东省。在省民政厅的积极运作下，向管辖地区规定「程序、选票、表格、验收、发证、建设」的「六大统一」。
在此种基础上，基于人民代表选出手续，各地终于制定村民委员会选举相关的专门规定，而有关各省『村民委员会组织法实施办法』所揭示的选举实施原则，即于各省级乃至县市层级予以确定。
村民委员会选举的过程
所谓农村基层选举，系指由选民直接选出村民委员会的主任、副主任及委员。在选举的过程中，除选举方式的选择以外，特别值得注意的是选举机构、选举资格和候选人的选出与决定等。
1选举机构
此处所指的「选举机构」乃是实施、监督与运作选举的主体，其名称依地域而有「村选举委员会」、「村选举工作领导小组」、「村选举工作小组」等各自不同（注３）。若由村民委员会改选选举原本的趣旨来看，福建省那种以改选前的村民委员会自身担任「选举机构」的情况属于例外，比较普通的方式是成立针对该次选举的专责机关。
因此，此时最受瞩目的是村级选举机构的组成。一般而言，其成员为３人～９人左右，但几乎都是由党支部、村民委员会成员、村民代表、村民小组长所构成，而党支部书记则担任选举机构的组长（或主任）指导选务工作（注４）。例如辽宁省义县的选举规定中，明记村级选举机构是由党支部及村民委员会成员、村民小组长、村民代表共５～９人所构成，而浙江省宁波市则规定：「一般以村党支部书记担任主任，再加上村民组长、村民代表及村内德高望重者５～７名组成」。
若由党支部系统和村民委员会这两项对立的外部思考来看，党支部系统有无进行「指导」即是检验选举制度民主性的条件。然而，几乎皆以「充分发挥村党支部指导的核心作用，强调村党支部对村民委员会改选工作的指导」为目的（注５），并无将党支部书记排除于外的事例。
就此而言，「选举机构」自身的选出过程即是问题，但此点亦无全国性统一规定。基本上，其组成存在下列各种方式。ａ．由村民会议乃至村民代表会议推荐（吉林县梨树县）；ｂ．由乡级人民政府乃至乡级人民代表大会主席团提名，而于村民代表大会审议、表决（山西省古交市）；ｃ．由村民代表会议推荐（江苏省、陜西省、山东省等）；ｄ．由党支部指名（浙江省）；ｅ．由村民团体指名（内蒙古）ｆ．由村民小组推荐（河南、黑龙江等）。在此次调查的重庆市事例中，则是采用上级乡（镇）选举委员会决定村民领导小组的人选。
在重庆郊外花溪镇建新村的事例中，由党支部书记、副书记、共青团、妇女连盟等７人组成选举工作领导小组；在象耳镇龙庙村则由党支部书记、村民小组长（２名）、基层干部及村民代表合计五人组成选举工作领导小组。如上述二例，在其它调查的村镇当中，党支部书记（乃至副书记）几乎毫无例外地成为选举工作领导小组的成员。
２选举资格
关于村级选举的选举资格，基本上不离宪法及其它法规所规定的一般选举资格。以重庆市为例，其规定为「满１８岁以上之村民，不论其民族、种族、性别、职业、家庭出身、宗教信仰、教育水准、财产状况和居住期间，均有选举资格。但依法被剥夺政治权利者除外。」（第１０条）。然而其实态并非如此单纯。
因为中国有户籍制度的存在，因而有符合宪法规定的选民，却因不是该村村民而不能成为村级选举选民的事例。因此，具选举资格者虽有义务进行选举资格登记，但因其户籍并非登载于该村，故须以其转入该村之日为准据，始得认定其选举资格。
在重庆市的事例中，「因工作、婚姻及家庭等事由，在本村居住半年以上，且善尽村民之义务者，虽未转入户籍，亦得进行选举登记」（第１２条）。此项规定有居住半年以上和履行村民义务的要件。在居住期间的规定方面，沈阳市规定为「半年」，此为同属长期的部分，而在较短期间方面有福建省及临汾市的「选举日１０日以前」。
此外，选举资格者名册的发表一般为选举日１０日以前。以重庆市为例，其规定为「选举
